In der Abteilung Medienerwerbung und -erschließung werden sämtliche konventionelle und digitale Medien für den Bestand der ThULB erworben und katalogisiert. Neben lizenzierten elektronischen Ressourcen werden auch digitalisierte Sammlungen formal und inhaltlich erschlossen. Eine weitere Aufgabe ist die Vermittlung von Fragen im Zusammenhang mit Metadaten und Regelwerken.
Die Abteilung organisiert den Zugang zu subskriptionspflichtigen elektronischen Ressourcen, führt Lizenzierungsverhandlungen auf lokaler und regionaler Ebene und wickelt sämtliche Vorgänge für das Open-Access-Publizieren an der Friedrich-Schiller-Universität Jena ab.
In Bezug auf die landesbibliothekarischen Aufgaben der ThULB ist die Abteilung zuständig für die Sammlung, Erschließung und Bereitstellung regionaler Pflichtexemplare in allen medialen Formen; in ihren Verantwortungsbereich gehört die Erstellung der Landesbibliographie für den Freistaat Thüringen.